1159-Starfysh：空间转录组与病理图像融合分析平台

这份研究介绍了一种名为 Starfysh 的计算工具箱，旨在通过整合空间转录组学与组织病理图像数据，深入剖析复杂组织中的细胞分布。与传统分析方法不同，Starfysh 采用深度生成模型与原型分析技术，无需依赖单细胞测序参考数据即可识别已知的细胞类型并发现新的细胞状态。该工具能有效克服由于技术局限导致的信号混合问题，从而实现高精度的细胞去卷积与组织内微环境特征提取。通过对多种乳腺癌亚型的集成分析，研究揭示了具有患者特异性的空间枢纽（Spatial Hubs）以及影响免疫反应的代谢重编程现象。此外，Starfysh 在处理跨样本异质性方面表现出色，能够描绘出不同疾病阶段中肿瘤与免疫细胞间的空间演变规律。总之，该工具为系统性探究健康与疾病状态下的复杂组织架构提供了一个功能强大的多模态分析平台。References:He, S., Jin, Y., Nazaret, A. et al. Starfysh integrates spatial transcriptomic and histologic data to reveal heterogeneous tumor–immune hubs. Nat Biotechnol 43, 223–235 (2025). https://doi.org/10.1038/s41587-024-02173-8前往小宇宙评论区与主播互动