EP16 所以什么是三维基因组@赵恒强

本期节目，我们请到了来自美国西北大学的赵恒强博士，一起探讨三维基因组的测序方法的由来，对于临床诊断和治疗的潜在应用，以及未来的发展方向。主要内容01:38 什么是三维基因组？04:50 什么是Hi-C技术09:10 如何优化三维基因组分析的运算量10:30 三维基因组的下游分析：染色体疆域；AB compartment；拓扑结构域（TAD）；染色质环（enhancer-promoter相互作用）14:48 三维基因组在医学遗传中的应用18:50 三维基因组在治疗中的应用20:13 能否通过人工智能预测三维基因组结构23:36 恒强实验室的最新研究进展相关术语及文献TAD：拓扑结构域（英语：Topological domains）或称为拓扑相关结构域（Topologically associating domains，简称TAD）是染色质亚结构的学术名称Hi-C技术：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22652625/从epigenetic数据直接预测三维基因组图谱的工具：https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.1714980114https://academic.oup.com/bib/article/25/2/bbae096/7630477https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-023-02934-9http://biorxiv.org/cgi/content/short/2024.07.17.603864v1?rss=1若对播客有任何问题或者投稿，请联系我 [email protected]，小红书/微博：@撸森森同时也可以加入听友qq群：975276283，谢谢Thanks♪(･ω･)ﾉ在小宇宙查看该单集文稿