Sidewinder: новый метод сборки сложных последовательностей ДНК через тройные узлы

Статья в журнале Nature описывает разработку Sidewinder — инновационной технологии сборки ДНК, которая использует трехсторонние узлы (3WJ) для создания сложных генетических последовательностей. В отличие от традиционных методов, эта система отделяет управляющую сборкой информацию от финального продукта с помощью съемных штрихкодов, что исключает появление нежелательных дефектов. Метод демонстрирует исключительную точность при объединении до 40 фрагментов и эффективно справляется с синтезом труднодоступных участков, таких как повторяющиеся сегменты и зоны с высоким содержанием ГЦ-пар. Исследователи успешно применили технологию для параллельной сборки различных генов в одной пробирке и создания масштабных комбинаторных библиотек с охватом более 400 000 вариантов. Благодаря частоте ошибок всего 1 на миллион соединений, Sidewinder открывает новые возможности для синтетической геномики, белковой инженерии и обучения нейросетевых биологических моделей.