La diversité sous nos pieds

Le document décrit une recherche novatrice sur la diversité microbienne dans les habitats terrestres, utilisant le séquençage d’ADN à lecture longue pour récupérer les génomes d’espèces non cultivées. L’étude, qui fait partie du projet Microflora Danica, a analysé 154 échantillons de sol et de sédiments, ce qui a permis d’identifier plus de 15 000 espèces microbiennes auparavant inconnues. De plus, les auteurs ont développé le flux de travail mmlong2, qui améliore la récupération de génomes assemblés à partir de métagénomes (MAGs) de haute qualité. Les résultats soulignent le potentiel encore inexploité des écosystèmes complexes pour élargir nos connaissances sur l’arbre phylogénétique de la vie procaryote et suggèrent la nécessité de projets métagénomiques plus localisés afin de cataloguer la diversité microbienne unique de certains environnements.Source: Sereika, M., Mussig, A.J., Jiang, C. et al. Genome-resolved long-read sequencing expands known microbial diversity across terrestrial habitats. Nat Microbiol 10, 2018–2030 (2025). https://doi.org/10.1038/s41564-025-02062-z