El científico David Baker y sus proteínas sintéticas revolucionan la medicina

El científico David Baker y sus proteínas sintéticas revolucionan la medicina • Las proteínas son las máquinas más maravillosas del mundo, asegura David Baker. • Este bioquímico de 60 años piensa revolucionar la medicina y los medicamentos con su proyecto. • Y todo desde su laboratorio del Instituto para el Diseño de Proteínas en Seattle. • Desde donde lidera un equipo de más de un centenar de científicos. • La mitad, biólogos y el resto, ingenieros. • Ayudados por la inteligencia artificial de aprendizaje profundo, diseñan proteínas con un potencial fascinante. • Las proteínas pueden adoptar millones de formas diferentes. • Su estructura determina la función que tendrán en nuestro organismo. • Llevan a cabo un montón de tareas importantes en nuestro cuerpo: digieren la comida, contraen los músculos, activan el sistema inmune. • Hacen que pensemos, respiremos o nos movamos. • También son capaces de desactivar virus y patógenos. • Lo difícil es acertar con la forma correcta de las proteínas para cada tarea. • La empresa Deepmind, propiedad de Google, decidió usar la IA para decodificar las formas de las proteínas, el Alphafold. • Hace tres años, descifró, del tirón, la estructura de los 200 millones de proteínas existentes en el planeta. • Una tarea que a nos habría costado cientos o miles de años. • Baker aprovechó este potencial para crear el software Rose TT Afold. • Sirve tanto para manipular las proteínas de la naturaleza como para crear otras nuevas, de la nada. • Con esas proteínas se hacen ensayos clínicos para una vacuna universal contra la gripe o medicamentos contra el cáncer, fármacos inteligentes para tratar enfermedades autoinmunes o terapias frente al dolor crónico. • Por lo que su impacto en la medicina y la farmacología es inmenso. • Del laboratorio de Baker ya han salido 17 start ups. • Las proteínas evolucionan a lo largo de millones de años para resolver problemas. • Gracias al diseño computacional podemos resolver estos inconvenientes sin esperar tanto tiempo. • Ahora, diseñan cada proteína enfocada a un objetivo. • Le dicen a la IA: Diseña una proteína que encaje en una célula cancerígena y desarrolle una función para bloquearla. • Incluso, diseñan proteínas para biodegradar el plástico, comerse sus componentes tóxicos. • Bruce trabaja en abierto, compartiendo su investigación y su código con el resto de la comunidad científica y otros usuarios. • Él es optimista y sabe qué hace falta movilizar una gran cantidad de recursos para usar estas herramientas. • Por lo tanto, ese enorme coste hará que se destine a hacer el bien más que para hacer el mal. • Sin embargo este progreso con la ingeniería genética necesita de unos límites tanto legales como éticos. • Una cosa es eliminar las enfermedades genéticas que pueda desarrollar un bebé y otra, mejorar las capacidades de un adulto. • Otro escenario inquietante es uno en donde la mejora genética del ser humano va a ser inevitable porque tendremos que competir con las máquinas. • Como vemos, la IA puede crear digitalmente muchas proteínas nuevas, desde cero. • Los científicos diseñan qué forma debe tener la nueva proteína y cómo debe ser la cadena de ADN que determinará que se pliegue de una forma en concreto. • El siguiente paso es hacerla realidad, fabricarla en el laboratorio. • Hay empresas que fabrican cadenas de Adn sintéticas. • Ese ADN llega al laboratorio en un microtubo, es un líquido. • Luego, con ese ADN se crea la cadena de aminoácidos y se introduce en una bacteria. • Y sirve como incubadora de la proteína. • Al final, extraen la proteína de la bacteria y comprueban si su diseño ha funcionado. • Las proteínas miden entre 1 y 10 nanómetros, una milmillonésima parte de un metro. • Por supuesto, toda esta operación es invisible al ojo humano y también para un microscopio normal. • Para verlo se utilizan microscopios de super resolución. • Parecido a un juego del Tetris para revolucionar la ciencia.